Wyposażenie laboratoryjne
laboratorium elektroforezy dwukierunkowej:
Zestaw PROTEAN IEF firmy BioRad (do przeprowadzenia procesu ogniskowania izoelektrycznego). Umożliwia on:
- jednoczesne izoelektroogniskowanie dwudziestu czterech 7cm pasków lub dwunastu pasków o dł.17 cm
- precyzyjne ustawienie parametrów napięcia na każdym etapie procesu
- kontrolowanie czasu lub volto-godzin na każdym etapie procesu
- zaprogramowanie pasywnej i aktywnej rehydratacji jako oddzielnej metody lub jako pierwszego etapu metody
Zestaw PROTEAN plus Dodeca Cell (do elektroforezy(SDS-PAGE) który:
- umożliwia jednoczesny rozdział do 12 żeli poliakryloamidowych o wymiarach 18,3 x 19,3 x 0,1 cm
- jest kompatybilny z urządzeniem PROTEAN IEF oraz zestawem do barwienia Dodeca Stainer Large
- wyposażony jest w pompę recyrkulacyjną umożliwiającą utrzymywanie stałej temperatury buforu elektrodowego w trakcie rozdziału
- jest zintegrowany z termostatem C10 firmy Thermo Haake, zapewniającym chłodzenie i utrzymanie stałej temperatury buforu elektrodowego w trakcie rozdziału
- jest systemem przeznaczonym do rozdziału żeli o dużym formacie pozwalającym na rozdział białek będących w większym stężeniu, co ma fundamentalne znaczenie dla późniejszej ich analizy z wykorzystaniem spektrometrii masowej
Dodeca Stainer Large (urządzenie przeznaczone do detekcji, barwienia żeli 2-D)
- umożliwia jednoczesne barwienie 12 wielkoformatowych żeli poliakryloamidowych
- zapewnia jednolite warunki barwienia żeli znacząco wpływając na jakość ich późniejszych analiz
- kompatybilny z barwnikami kolorymetrycznymi oraz fluorescencyjnymi
kalibrowany densytometr optyczny GS 800
(do cyfrowego zapisu obrazu żelu 2-D)
- zapewnia rozdzielczość w granicach 36,3 – 127 mikronów
- obszar skanowania 29 x 40 cm
- jest wyposażony w kalibracyjną skalę odcieni szarości zapewniającą powtarzalne wartości skanowania
- jest wyposażony w oprogramowanie Quantity One
- umożliwia skanowanie żeli 1-D, 2-D, membran barwionych kolorymetrycznie oraz kliszy fotograficznych
laboratorium spektrometrii mas:
EXQuest Spot Cutter (do automatycznego wycinania wybranych spotów białkowych), charakteryzuje się:
- szybkim wycinaniem białek z żeli 1-D, 2-D i membran (do 600 cięć na godzinę)
- kompatybilnością z oprogramowaniem komputerowym PDQuest(dla żeli 2-D)oraz Quantity One(dla żeli 1-D)
- możliwością wycinania żeli barwionych kolorymetrycznie i fluorescencyjnie
- wysoką powtarzalnością (wydajność wyższa niż 99,5%
- dokładność cięcia do 100 mikrometrów
- automatyczną rehydratacją żeli w trakcie pracy
- jednoczesną obróbką do 4 żeli
Spektrometr masowy microflex (Bruker Daltonics)
- wyposażony w źródło jonów microScout z technologią PIE™ i laser azotowy 20Hz
- posiada reflektron zwiększający rozdzielczość urządzenia
- posiada detektor TOF wyposażony w opcję autoPSD umożliwiającą eksperymenty pseudo-MS/MS z wyborem jonu macierzystego
- posiada system wyposażony w algorytm WhisperMode™ usuwający z widma zanieczyszczenia tła generowane w laboratorium
Oprogramowanie komputerowe - programy:
- PDQuest 8.0.,
- Quantity One,
- flexControl,
- flexAnalysis,
- BioTools
umożliwiją m.in.: porównywanie i identyfikację różnic w profilach białkowych, prowadzenie analiz zmian ilościowych i jakościowych (zmian ekspresji) w proteomach, statystyczną analizę obrazów, zarządzanie pracą poszczególnych wysokospecjalistycznych aparatów na platformie 2DE i MS bioinformatyczną obróbkę i interpretację widm masowych, przeszukiwanie białkowych baz danych i identyfikację białek, tworzenie map białkowych.
Ponadto wyposażenie Katedry stanowią:
- zestaw do elektroforezy 1-DE PROTEAN II xi Cell
- zestaw do elektroforezy 1-DE oraz 2-DE Mini-PROTEAN Tetra Cell
- zestaw do elktrotransferu białek TRANS-BLOT SDSEMI-DRY TRANSFER CELL
- system do dokumentacji i analizy materiałów znakowanych chemiluminescencyjnie, chemifluorescencyjnie, fluorescencyjnie oraz znakowanych metodą kolorymetryczna VersaDoc™ 4000 MP
- spektrometr absorpcji atomowej AAnalyst 400 z systemem do automatycznego rozcieńczania próbek AutoPrep-50
- spektrofotometr mikropłytkowy PowerWave XS
- zestaw do homogenizacji i izolacji DNA z tkanek Tissue Lyser
- system do zatężania DNA, RNA nukleotydów i białek oraz przygotowywania prób do elektroforezy żelowej Koncentrator 5301
- spektrofotometry Marcel Media Plus oraz Marcel 330
- homogenizatorem Dl 25 basic
- autoklaw parowy STERILIX BABY
a także:
chlorimetr 50cl i 100cl, osmometr, łaźnia ultradźwiękowa RK 255H Bandelin, system do dejonizacji wody WCA-R03-DPRS-X, pH-metr Cyber Scan pH 500, wirówki z chłodzeniem: CENTRIFUGE 5804R i 5417R, mieszadła magnetyczne , wytrząsarki laboratoryjne, zamrażarka głębokiego mrożenia (-80˚C)
