profesor
Katedra Mikrobiologii i Biotechnologii
Tel. 91-449-6714
E-mail: karol.fijalkowski@zut.edu.pl
Tematyka badawcza
Opracowanie i optymalizacja nowatorskich sposobów efektywnego wytwarzania celulozy bakteryjnej oraz metod jej modyfikacji i funkcjonalizacji, a także wykazanie nowych kierunków jej zastosowania.
Analiza mechanizmów szczepowo zależnej, zwiększonej efektywności działania środków przeciwdrobnoustrojowych wobec bakterii patogennych w obecności wirującego pola magnetycznego.
Analiza drobnoustrojów z rodzaju Staphylococcus izolowanych od ludzi i zwierząt oraz z żywności.
Publikacje
Research Gate: https://www.researchgate.net/profile/Karol-Fijalkowski
Scopus: https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=57001089000
ORCiD: orcid.org/0000-0002-4915-6298
Dorobek naukowy
Na dzień 31.12.2022 r., mój dorobek naukowy obejmuje łącznie 83 publikacje, w tym 69 prac opublikowanych w czasopismach indeksowanych w bazie JCR. Łączny IF wynosi 241, łączna liczba punktów MNiSW 1984, a łączna liczba punktów MEiN 6850. Ponadto, jestem współautorem 3 rozdziałów w książce oraz 18 patentów i 3 zgłoszeń patentowych (obecnie rozpatrywanych w UP). Liczba cytowań (bez autocytowań) moich prac wynosi 698 (Scopus) i 635 (Web of Science), a indeks Hirscha 18 (Scopus) i 17 (Web of Science).
Przebieg pracy naukowej
Działalność naukową rozpocząłem w październiku 2002 roku w Katedrze Immunologii i Mikrobiologii (KIiM) Wydziału Biotechnologii i Hodowli Zwierząt (WBiHZ) Akademii Rolniczej (AR) w Szczecinie, prowadząc badania w ramach pracy dyplomowej realizowanej na studiach magisterskich pt.: Kształtowanie się wskaźników odporności humoralnej u prosiąt noworodków i macior w okresie okołoporodowym, z uwzględnieniem białek ostrej fazy. Praca została wykonana pod kierunkiem prof. Antoniego Furowicza.
Po obronie pracy magisterskiej, z dniem 1 października 2005 r., rozpocząłem naukę na studiach doktoranckich. Badania w ramach pracy doktorskiej wykonywałem również w KIiM WBiHZ AR w Szczecinie (w późniejszym okresie Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie, ZUT), które ukończyłem w 2010 r. obroną pracy doktorskiej (z wyróżnieniem). Praca doktorska pt.: Superantygenowe i leukocytotoksyczne czynniki wirulencji wytwarzane przez szczepy Staphylococcus aureus wyizolowane z mleka krów z objawami mastitis, wykonywana była pod kierunkiem Pani dr hab. Danuty Czernomysy-Furowicz, prof. ZUT.
W trakcie studiów doktoranckich odbyłem również staże na University College of Dublin i Trinity College, w Dublinie, w Irlandii. Podczas pobytów stażowych zdałem egzaminy potwierdzające znajomość języka angielskiego, Cambridge First Certificate in English (FCE) oraz International English Language Testing System (IELTS, academic).
W latach 2009-2012 pracowałem jako lektor języka angielskiego w Szczecińskiej Szkole Wyższej Collegium Balticum. Od 2010 roku zatrudniony jestem na stanowisku adiunkta (obecnie profesora uczelni) w Katedrze Mikrobiologii i Biotechnologii WBiHZ ZUT. Od 2012 roku prace badawcze wykonuję w Centrum Dydaktyczno-Badawczym Nanotechnologii ZUT. W 2012 roku, w celu poszerzenia umiejętności zawodowych oraz kompetencji z zakresu mikrobiologii, odbyłem specjalizację z zakresu mikrobiologii, która prowadzona była przez Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie. W trakcie specjalizacji pracowałem również w klinicznej Pracowni Mikrobiologicznej PUM.
W roku 2016 uzyskałem stopień doktora habilitowanego w dziedzinie nauk biologicznych i dyscyplinie naukowej biotechnologia. Stopień doktora habilitowanego nadany został mi przez Radę Wydziału Biologii i Biotechnologii Uniwersytetu Marii Curie-Skłodowskiej w Lublinie za cykl publikacji pt. Analiza wpływu wirującego pola magnetycznego na mikroorganizmy oraz możliwości jego wykorzystania w procesach biotechnologicznych.
Po uzyskaniu stopnia naukowego doktora habilitowanego postanowiłem rozwijać zagadnienia związane z dwoma kierunkami badawczymi, które zainicjowałem w okresie pomiędzy uzyskaniem stopnia doktora i doktora habilitowanego.
Pierwszy kierunek badawczy związany jest z oddziaływaniami wirującego pola magnetycznego na drobnoustroje, natomiast drugi koncentruje się wokół tematyki związanej z wytwarzaniem, modyfikacją i funkcjonalizacją oraz zastosowaniem nanobiocelulozy, czyli celulozy wytwarzanej przez bakterie (celuloza bakteryjna).
Kierunek badawczy, któremu od początku mojej pracy naukowej poświęcam szczególną uwagę związany jest z bakteriami z rodzaju Staphylococcus, a w szczególności z antybiotykoopornością i czynnikami wirulencji wytwarzanymi przez szczepy S. aureus izolowanymi od ludzi, zwierząt i żywności.
W dniu 4 sierpnia 2023 r., postanowieniem Prezydenta Rzeczypospolitej został nadany mi tytuł profesora nauk ścisłych i przyrodniczych w dwóch dyscyplinach naukowych, biologia i biotechnologia (https://www.zut.edu.pl/.../Aktualne/FU_59_pracownicy.pdf).
Projekty naukowo-badawcze
Superantygenowe i leukocytotoksyczne czynniki wirulencji wytwarzane przez szczepy Staphylococcus aureus wyizolowane z mleka krów z objawami mastitis, okres realizacji: lata 2008-2010, MNiSW GRANT PROMOTORSKI, N N308 076334, wykonawca.
An investigation of the composition and anti-microbial properties of ImmunoSAL, okres realizacji: 06-10.2007 r., project badawczo-rozwojowy ENTERPRISE IRELAND INNOVATION PARTNERSHIP, IP/2004/0203, wykonawca (research assistant).
Biodegradowalne kopolimery amfifilowe zawierające naturalnie bioaktywne składniki dla projektowania nowoczesnych materiałów o aktywności przeciwdrobnoustrojowej, okres realizacji: lata 2013-2015, Narodowe Centrum Nauki OPUS 2, DEC-2011/03/B/ST8/06353, wykonawca.
Zastosowanie innowacyjnego rozwiązania konstrukcyjnego biorekatora wspomaganego wirującym polem magnetycznym (WPM) do intensyfikacji procesu produkcji biomasy mikroorganizmów probiotycznych, okres realizacji: lata 2014-2015, INKUBATOR INNOWACYJNOŚCI projekt realizowany przez Regionalne Centrum Innowacji i Transferu Technologii ZUT w ramach programu Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego, wykonawca.
Projekt, budowa i optymalizacja działania bioreaktora wspomaganego wirującym polem magnetycznym do produkcji celulozy bakteryjnej, okres realizacji: lata 2015-2017 (realizacja projektu w roku 2017 przypadała na okres po uzyskaniu stopnia doktora habilitowanego), Narodowe Centrum Badań i Rozwoju LIDER 5, LIDER/011/221/L-5/13/NCBR/2014, kierownik projektu.
Analiza mechanizmów zwiększonej efektywności substancji przeciwdrobnoustrojowych względem biofilm w obecności wirującego pola magnetycznego, okres realizacji: lata 2018-2022, Narodowe Centrum Nauki OPUS 14, OPUS 2017/27/B/NZ6/02013, projekt realizowany w ramach konsorcjum z instytutem naukowo-badawczym Sieć Badawcza Łukasiewicz - PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologi, kierownik projektu i konsorcjum naukowego.
Biodegradowalne, przeciwbakteryjne i przeciwwirusowe filtry na bazie bionanocelulozy do zastosowania w maseczkach ochronnych, okres realizacji: 07-09.2020 r., projekt badawczo-rozwojowy ODPOWIEDZIALNY SPOŁECZNIE PROTO_LAB realizowany w ramach Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Zachodniopomorskiego 2014-2020, Proto_lab/K1/2020/U/11, wykonawca i koordynator zadań obejmujących badania biologiczne.
Testowanie w warunkach rzeczywistych innowacyjnych maseczek ochronnych (NanoBioCell) z bionanocelulozy, okres realizacji: 04-09.2021 r., projekt badawczo-rozwojowy ODPOWIEDZIALNY SPOŁECZNIE PROTO_LAB realizowanego w ramach Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Zachodniopomorskiego 2014-2020, Proto_lab/K2/2021/U/7, wykonawca i koordynator zadań obejmujących badania biologiczne.
Opracowanie założeń dla technologii oczyszczania oraz zagospodarowania odpadów powstających w procesie oczyszczania ścieków w Oczyszczalni Ścieków Ostrów Grabowski; okres realizacji: 09.2021-09.2022 r., projekt badawczo-rozwojowy w ramach Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Zachodniopomorskiego 2014-2020, Oś Priorytetowa 1 Gospodarka, Innowacje, Nowoczesne Technologie, Działanie 1.1. Projekty badawczo-rozwojowe przedsiębiorstw, Typ projektu 1 Małe projekty B+R; RPZP.01.01.00-32-MR25/20-00; wykonawca i koordynator zadań obejmujących badania mikrobiologiczne.
Staże naukowe
School of Agriculture, Food Science and Veterinary Medicine, University College Dublin, Dublin, Irlandia; 04.08.2010-20.08.2010 r., staż naukowy w zakresie wykorzystania technik ELISA, SDS-PAGE i Western Blotting w badaniach biochemicznych i mikrobiologicznych, opiekun naukowy dr Jane Irwin.
School of Agriculture, Food Science and Veterinary Medicine, University College Dublin, Dublin, Irlandia; 27.06.2007-25.09.2007 r., staż naukowy - udział w badaniach dotyczących antyadhezyjnych właściwości białek mleka wobec bakterii Streptococcus mutans i Salmonella Typhimurium do hydroksyapatytu, a także analiz efektu cytotoksycznego wywieranego przez białka mleka na linię komórek Caco-2; wykonawca w grancie An investigation of the composition and anti-microbial properties of ImmunoSAL finansowanym przez Enterprise Ireland Innovation Partnership, opiekun naukowy dr Jane Irwin.
School of Biochemistry and Immunology, Department of Biochemistry, Trinity College Dublin, Dublin, Irlandia; 05.02.2007-16.02.2007 r., staż naukowy w zakresie hodowli in vitro wybranych linii komórkowych oraz wykonywania testów cytotoksyczności opartych o pochłanianie czerwieni obojętnej, opiekun naukowy prof. Clive Williams.
School of Biochemistry and Immunology, Department of Biochemistry, Trinity College Dublin, Dublin, Irlandia; 20.02.2006-02.03.2006 r., staż naukowy w zakresie analizy ekspresji genów z wykorzystaniem metody Real Time PCR, opiekun naukowy prof. Clive Williams.
School of Agriculture, Food Science and Veterinary Medicine, University College Dublin, Dublin, Irlandia; 01.08.2006-15.09.2006 r., staż naukowy - udział w badaniach dotyczących opracowania innowacyjnego systemu izolacji i oczyszczania enzymów z grupy chitynaz z płynu oskrzelowo-pęcherzykowego koni opartego o chromatografie powinowactwa; opiekun naukowy dr Jane Irwin.
Katedra i Zakład Mikrobiologii Farmaceutycznej i Parazytologii, Wydział Lekarski, Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu; 07.01.2013-12.04.2013 r., udział w badaniach naukowych związanych z opracowaniem i optymalizacją metod służących do oceny żywotności i aktywności metabolicznej mikroorganizmów w tym mikroorganizmów w biofilmie, opiekun naukowy dr hab. n. med. Adam Junka.
Katedra i Zakład Mikrobiologii i Immunologii, Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie; lata 2012-2014, staż podstawowy w ramach specjalizacji z mikrobiologii dla biologów i biotechnologów, opiekun prof. dr hab. n. med. Stefania Giedrys – Kalemba.
Katedra i Zakład Mikrobiologii i Immunologii, Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie; 17.09.2012-12.10.2012 r., staż naukowy dotyczący wykorzystania techniki PFGE w celu porównania na poziomie molekularnym podobieństwa lub zróżnicowania szczepów bakterii reprezentującego jeden gatunek, opiekun naukowy prof. dr hab. n. med. Stefania Giedrys – Kalemba.
Staże dydaktyczne
(ERASMUS+ Staff Mobility for Teaching oraz Staff Mobility for Training)
School of Agriculture, Food Science and Veterinary Medicine, University College Dublin, Irlandia, 04-11.08.2010 r., opiekun prof. Jane Irwin.
School of Agriculture, Food Science and Veterinary Medicine, University College Dublin, Irlandia, 12-20.08.2010 r., opiekun prof. Jane Irwin.
School of Agriculture, Food Science and Veterinary Medicine, University College Dublin, Irlandia, 19-26.09.2011 r., opiekun prof. Jane Irwin.
Faculty of Veterinary Medicine, Technical University of Lisbon, Portugalia; 16-30.07.2012 r., opiekun prof. Cristina Vilela.
School of Agriculture, Food Science and Veterinary Medicine, University College Dublin, Irlandia, 10-14.09.2012 r., opiekun prof. Jane Irwin.
Faculty of Agronomy, Agricultural University of Plovdiv, Bułgaria, 20-26.05.2013 r., opiekun prof. Małgorzata Berova.
School of Agriculture, Food Science and Veterinary Medicine, University College Dublin, Irlandia, 24-31.03.2014 r., opiekun prof. Jane Irwin.
Faculty of Agronomy, Agricultural University of Plovdiv, Bułgaria, 29.06.-06.07.2014 r., opiekun prof. Małgorzata Berova.
Faculty of Agricultural and Food Sciences and Environmental Management, University of Debrecen, Węgry, 09-14.03.2015 r., opiekun prof. Andras Javor.
Facultad de Farmacia, Universidad CEU San Poblo, Madryt, Hiszpania, 17-24.05.2016 r., opiekun prof. Ana Gradillas.
Facultad de Farmacia, Universidad CEU San Poblo, Madryt, Hiszpania, 05-09.04.2017 r., opiekun prof. Ana Gradillas.
School of Biology Faculty of Science, Aristotele University of Thessaloniki, Grecja, 27.05-02.06.2018 r., opiekun prof. Alexandros Triantafyllidis.
Department of Agricultural Sciences, Biotechnology & Food Science, Cyprus University of Technology, Cypr, 10-15.04.2019 r., opiekun prof. George A. Manganaris.
Faculty of Exact Sciences and Engineering, Decembrie 1918” University of Alba Iulia, Rumunia, 09-15.03.2019 r., opiekun prof. Muntean Cipriana.